Servicios ofertados

Extracción, aislamiento y expansión de linfocitos infiltrados de tumor TILs.

Identificación de dianas terapéuticas mediante análisis genómicos “in silico”, en condiciones patológicas específicas:

• Se utilizarán bases de datos transcriptómicas o de RNAseq de datos públicos o proporcionados por el investigador.
• Se realizará un estudio de la calidad del material.
• Se utilizará R-Bioconductor para la normalización de datos y para la identificación de expresión diferencial entre genes o condiciones, o para la identificación de alteraciones de genómicas de interés.
• Se podrán realizar análisis de enriquecimiento funcional, interacción de proteínas, presencia de gen/proteína a estudio en el surfaceoma o asociación con pronóstico, dependiendo de la necesidad del investigador.
• Se podrán realizar los mismos análisis en condiciones específicas solicitadas por el investigador, bajo tratamiento, resistencia a un fármaco o presencia de una determinada condición genómica (mutación, amplificación) o epidemiológica (edad, fumador o enfermedad).

Identificación de biomarcadores de actividad o respuesta: Utilizando la misma metodología descrita previamente se podrán identificar marcadores transcriptómicos o alteraciones estructurales genómicas asociadas a condiciones médicas como respuesta o resistencia a un determinado tratamiento.

Diseño de antígenos y desarrollo de anticuerpos (servicio externalizado):

• Dependiendo de la proteína a estudio y basándonos en su estructura tridimensional se diseñará el antígeno de la parte más expuesta y con capacidad antigénica.
• Dependiendo de la proteína a estudio, se podrá sintetizar el antígeno o se producirá en células de mamífero tras infectarlas (CHO o HEK293).
• Posteriormente se realizará: inmunización y análisis del suero, hibridación de linfocitos, cribado de hibridomas e isotipificación, clonación de hibridomas oligoclonales y congelación de los seleccionados, y secuenciación de anticuerpo, producción y purificación.
• Evaluación bioquímica de su especificidad

Evaluación preclínica de compuestos-non-clinical pharmacology (TILs):

• Se podrá ofrecer como servicio para distintos grupos de investigación que quieran utilizar estas células para estudios de co cultivos celulares en distintas condiciones predeterminadas
• También para evaluar marcadores de respuesta inmunológica así como respuesta a compuestos farmacológicos en experimentos in vitro.

Técnicas de cultivo celular con líneas celulares y tejido primario:

1. Estudios genómicos:

• • Extracción de ADN y ARN de líneas celulares.
  • Silenciamiento con siRNA.
  • Cuantificación mediante PCR cuantitativa de determinados genes, tanto de forma basal como tras tratamientos de interferencia mediante silenciamiento con siRNA.

2. Estudios proteómicos:

• • Extracción de proteína de líneas celulares de forma basal y tras tratamientos de diferentes compuestos.
  • Cuantificación de proteína mediante la utilización de BCA, y posterior lectura de absorbancia en el espectrofotómetro.
  • Evaluación mediante Western Blot de diferentes proteínas involucradas en diferentes vías relacionadas con Ciclo Celular y Apoptosis.
  • Evaluación mediante Western Blot de las proteínas dianas inhibidas por los compuestos utilizados. Evaluación de la efectividad y toxicidad de fármacos