Servicios ofertados

A: Unidad de Genómica. Laboratorio de Genómica y Microarrays (LABGEN)

  • Análisis de la calidad del RNA mediante el Bioanalizador.
  • Análisis Transcriptómico (mRNA). Microarrays de GE (Gene Expression).
  • Análisis de CNV (Copy-Number-Variation) / Microarrays de array-CGH (Comparative Genomic Hybridization) y SNP-CGH.
  • Análisis de expresión de microRNAs. Microarrays de miRNAs.
  • Análisis de metilación del DNA. Microarrays de “CpG-island” y de metilación.
  • Análisis de Inmunoprecipitación de Cromatina. Microarrays de ChIP-on-chip.
  • Realización de “Custom Microarrays” mediante e-array.

B: Unidad de Genómica. Laboratorio de Oncología Molecular (LABINMUNO)

  • Estudio de mutaciones y grandes reordenamientos en BRCA1
  • Estudio de mutaciones y grandes reordenamientos en BRCA2
  • Estudio de mutaciones y grandes reordenamientos en MLH1
  • Estudio de mutaciones y grandes reordenamientos en MSH2
  • Estudio de mutaciones y grandes reordenamientos en MSH6
  • Estudio de mutaciones en P53
  • Estudio de mutaciones en MYH
  • Estudio de mutaciones en RAD51C
  • Estudio de mutaciones en OGG1
  • Estudio de mutaciones en NUDT1
  • Estudio de mutaciones en XRCC1
  • Estudio de mutaciones en Pi3K
  • Estudio de mutaciones en KRAS Y NRAS
  • Estudio de mutaciones en BRAF
  • Estudio de microsatélites, secuenciación, HRM, fragmentos.
  • Purificación de ADN, ARN, cADN de sangre, tejidos y tumores en parafina
    PCR digital, NGS
  • Detección de células tumorales circulantes.

C: Unidad de Genómica. Laboratorio de Inmunogenética y Secuenciación (LABINMUNO)

 

  • Secuenciación del genoma.
  • Análisis de fragmentos.
  • Estudio de microsatélites.
  • Estudio de marcadores genéticos con PCR a tiempo real.
  • Estudio de expresión génica.
  • Otros estudios de genómica.

D: Unidad de Genómica. Laboratorio de Microbiota (LABMIC)

  • Extracción de ADN bacteriano de diversos nichos (heces, intestino, aire, etc)
  • Preparación de muestras, generación de librerías y secuenciación del gen ribosomal 16S (ADN y ARN) mediante equipos de secuenciación masiva
  • Análisis e integración de los datos de las secuencias bacterianas mediante análisis bioinformático
  • Cuantificación de productos bacterianos en sangre y orina (AGCC, p-cresol, TMAO, etc)
  • Cuantificación de marcadores de inflamación (IL-1β, IL-18, TNFα, etc) y de activación inmune (CD4+/CD38+, CD8+/CD38+, CD8+/CD38+/HLADR+)
  • Cuantificación de marcadores de permeabilidad de la barrera intestinal (relación lactulosa/manitol) y de translocación bacteriana (LPS , CD14s)

Estos servicios cuentan con unas tarifas en vigor aprobadas.

Clica aquí para descargar las tarifas (PDF).

 

Más info

Clientes actuales:

    • HCSC:
      • Servicio de Anatomía Patológica (Dr. Julián Sanz) (pasado)
      • Unidad de Gestión Clínica de Inmunología (Dr. Silvia Sánchez Ramón)
      • Servicio de Oncología Médica.
      • Servicio de Psiquiatría.
      • Unidad de Gestión Clínica de Microbiología Clínica.
      • Unidad de Gestión Clínica de Análisis Clínicos.
      • Servicio de Hematología y Hemoterapia.
      • Unidad de Gestión Clínica de Reumatología
      • Servicio de Anatomía Patológica.
      • Servicio de Neurología.
      • Servicio de Medicina Interna.
      • Grupo Riesgo Cardiovascular
      • Servicio Cirugía General y del Aparato Digestivo
      • Servicio de Endocrinología
      • Servicio de Cardiología
    • Bayer
    • Pharmamar
    • Instituto Carlos III:
      • Departamento de Bioinformática Médica (Dra. Victoria López Alonso)
    • Consejo Genético:
      • Hospital de la Princesa
      • Hospital Puerta de Hierro
      • Hospital del Henares
      • Hospital del Niño Jesús
      • Hospital de Torrejón
    • Hospital Insular de Canarias: Laboratorio de Análisis Clínicos
    • Universidad Complutense de Madrid: Facultad de Medicina
    • Servicio de Nefrología, Hospital Príncipe de Asturias, Alcalá de Henares, Madrid
    • Departamento de Hematología Traslacional, Instituto de Investigación Hospital 12 de octubre (i+12), Madrid
    • Departamento de Fisiología, Facultad de Medicina, UCM, Madrid
    • Grupo Nefrología e Hipertensión, Patología Vascular y Diabetes, Fundación Jiménez Díaz-UAM, Madrid
    • Instituto de Biología y Genética Molecular (IBGM)-CSIC, Valladolid

Potenciales clientes:

  • HCSC:

  • Unidad de Lípidos e Hipertensión.

  • Servicio de Oncología Médica (Ensayos Clínicos).

  • Unidad de Gestión Clínica de Inmunología (Ensayos Clínicos).

  • Servicio de Microbiología (Ensayos Clínicos).

  • Cualquier usuario que esté interesado el estudiar la composición de la microbiota intestinal mediante técnicas de secuenciación masiva.

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Publicaciones relevantes:

  • AÑO PUBLICACIÓN TÍTULO
    2012 BMC Cancer, vol. 12, no. 1. p. 260, 2012 Colon cancer molecular subtypes identified by expression profiling and associated to stroma, mucinous type and different clinical behavior,
    2015 Nat. Med., Nov;21(11):1350-6, 2015 The consensus molecular subtypes of colorectal cancer

    El Laboratorio de Genómica y Microarrays es miembro de la Red de Laboratorios de la Comunidad de Madrid, con el nº de registro 325.

  • Nº Registro 325

FORMACIÓN INVESTIGADORA

  • 2019

    • Trabajo de Fin de Máster en Medicina Traslacional (UCM):

    Efecto de la cirugía bariátrica sobre la composición de la microbiota intestinal de pacientes con obesidad mórbida. Comparación de las técnicas Bypass gástrico y SADI-S. Calificación: 9.6.

    • Trabajo de Fin de Máster en Bioinformática y Biología Computacional (UAM):

    Desarrollo de un pipeline para el análisis de datos metagenómicos obtenidos por secuenciación de múltiples regiones variables del gen rRNA 16S mediante secuenciación masiva. Calificación: 9,7.

    2018

    • Trabajo de Fin de Máster en Medicina Traslacional (UCM):

    Papel de la microbiota intestinal en el desarrollo de insuficiencia cardiaca en un modelo de ratas hipertensas. Calificación: 10.

    • Tesis Doctoral en la Facultad de Medicina de la UCM:

    Estudio de la relación de los metabolitos bacterianos trimetilamina N-óxido y trimetilamina con la enfermedad cardiovascular y la función renal en pacientes infectados por VIH. Calificación: Sobresaliente cum laude por unanimidad.

    2017

    • Trabajo de Fin de Grado en Biología (UCM):

    Análisis de la microbiota intestinal en un modelo experimental de esclerosis múltiple. Calificación: 8,5.

     

    2016

    • Trabajo de Fin de Máster en Microbiología (UAM):

    Papel de la microbiota intestinal en el infarto agudo de miocardio asociado o no a obesidad. Calificación: 9,5.

    • Trabajo de Fin de Máster en Microbiología (UAM):

    Efecto de un antioxidante mitocondrial sobre la microbiota intestinal en la obesidad. Calificación: 10.

    Sección 1 Solicitante:

    • Sección 2 Proyecto:

    • Sección 3 Muestras:

      I-DONANTE

    • II-DONACIÓN

    • III-MUESTRAS